1月8日：华南植物园举行侨联成立20周年纪念活动。 

　　1月9日：周国逸研究员等完成的“华南热带亚热带森林生态系统恢复/演替过程碳、氮、水演变机理”研究成果获国家自然科学二等奖，这是华南植物园历史上第一个主持完成的获得国家自然科学二等奖的项目。蒋跃明研究员作为骨干成员参与的“南方主要易腐易褐变特色水果贮藏加工关键技术”获国家科技进步二等奖。 

　　1月9-10日：党委副书记任海、副主任魏平及各党支部成员深入丰顺县留隍镇与结对的党支部开展城乡基层党组织“五个一”互帮互助活动。 

　　1月10日：由华南植物园、国际植物园保护联盟（BGCI）、美国纽约布鲁克林植物园（BBG）及Others Are Us（OAU）机构联合举办的“以花交友”现场绘画迎新年活动在华南植物园举行。 

　　1月12日：中科院创新工程重要方向性项目“能源植物的筛选和定向改良研究”启动仪式在华南植物园举行。 

　　1月13-20日：第三世界科学院院士、巴基斯坦科学院院士、巴基斯坦农业大学Muhammad Ashraf教授一行访问华南植物园。 

　　1月14日：全国人大常委会副委员长、中科院院长路甬祥发来贺信，热烈祝贺华南植物园荣获2008年度国家自然科学二等奖。 

　　1月：华南植物园被广东省体育局评为广东省第九届“体育节”活动先进单位。 

　　1月16日：华南植物园在棕榈园陶铸像前隆重集会纪念陶铸同志诞辰101周年。 

　　1月21日：中科院副院长丁仲礼到华南植物园调研野外台站的建设与管理工作。 

　　1月21日：中科院生命科学与生物技术局局长张知彬到华南植物园调研。 

　　1月25日：全国人大常委会副委员长、九三学社中央委员会主席韩启德在广东省政协副主席姚志彬、中科院广州分院院长陈勇等陪同下到华南植物园参观考察。 

　　1月28日：原中央军事委员会副主席、国务委员兼国防部部长曹刚川上将到华南植物园参观考察。 

　　2月2日：中共中央政治局委员、国务院副总理回良玉对华南植物园上报的《中科院专报信息》“中科院专家关于进一步加强我国与秘鲁生物战略资源合作的建议”做出批示。 

　　2月9日：华南植物园宣布新一届行政领导班子。根据中科院党组《关于华南植物园行政领导班子任免通知》：黄宏文同志任华南植物园主任，任海（兼）、魏平、傅声雷同志任副主任，任期5年；免除周国逸同志副主任职务（保留副局级待遇）。 

　　2月17日：华南植物园召开全园职工大会，传达中科院2009年度工作会议的精神，总结全园2008年度工作，对2009年工作进行部署。 

　　2月17-20 日：闫俊华研究员代表中国陆地生态系统通量观测研究网络参加在日本筑波举行的“东亚碳2009研讨会”。 

　　2月19-20日：中科院第五届植物园标本馆科普网络委员会工作会议在华南植物园举行。 

　　2月20日：华南植物园被中科院体育协会授予“中国科学院2008年全民健身月展示活动先进单位”称号。 

　　2月23日：华南植物园召开深入学习实践科学发展观活动总结会议。 

　　2月27日-3月8日：日本京都大学Atsushi Kawakita博士一行到访华南植物园开展学术交流活动。 

　　3月10日：广东省人民政府副秘书长江海燕到华南植物园参观考察，对院省市共建植物园的成果进行现场调研。 

　　3月12日：中共中央政治局委员、国务院副总理回良玉对华南植物园上报的《中科院专报信息》“中科院专家关于利用植物和生态工程集成技术治理我国大型城市水环境的建议”做出批示。 

　　3月14日：中共中央政治局常委、国家副总理李克强对华南植物园上报的《中科院专报信息》“中科院专家关于利用植物和生态工程集成技术治理我国大型城市水环境的建议”做出重要批示：“……对生态治污的成功经验要注意总结和有效推广。” 

　　3月14日：原中央军委委员、中国人民解放军总参谋长傅全有上将在广州军区有关领导的陪同下参观华南植物园。 

　　3月26日：中科院规划战略局局长潘教峰、生物局副局长苏荣辉等到鼎湖山国家级自然保护区考察指导工作。 

　　3月29-30日：科技部科技基础性工作专项“非粮柴油能源植物与相关微生物资源的调查、收集与保存”（2008FY110400）启动会议在华南植物园隆重召开。 

　　3月31日-4月1日：中科院、广东省、广州市三方共建华南植物园项目验收会议在该园隆重举行，中科院副院长李家洋、广东省副省长宋海、广州市政府常务副市长邬毅敏等出席大会。共建华南植物园工程获得高度评价并全面通过验收。 

　　4月3日：根据穗科院人〔2009〕15号文《关于夏汉平、闫俊华同志任华南植物园主任助理的批复》，任命夏汉平、闫俊华同志为园主任助理。 

　　4月6日：中共中央政治局委员、广东省委书记汪洋视察华南植物园。 

　　4月6日：周国逸研究员主持的973项目“中国主要类型生态系统服务功能与生态安全”项目第一课题“森林生态系统服务功能形成机理”启动会议在华南植物园召开。 

　　4月22日：国家环保部组织国家发改委、财政部、住房城乡建设部、水利部、科技部、国家林业局、中科院等8部委，以及华南环科所等10个院所的专家组成“生态治污示范与推广”项目技术专家团到华南植物园进行专题调研与现场参观。 

　　4月30日：创新三期综合实验大楼项目举行奠基仪式。 

　　5月5-8日：由华南植物园、国际植物园保护联盟（BGCI）等单位主办的“第二届国际木兰科植物学术讨论会”在广州召开，来自美国、英国、日本等22个国家和地区的150余名代表出席会议。 

　　5月5日：在“第二届国际木兰科植物学术讨论会”开幕式上，华南植物园和BGCI、国际木兰协会（MSI）共同签订“世界木兰中心”（World Magnolia Center）的合作协议并揭牌，标志着该中心从此落户华南植物园。 

　　5月22-23日：由华南植物园等单位主办的“珍稀濒危植物--伯乐树迁地保育研究研讨会”在广东东莞举行。 

　　5月26-27日：由广州市科学技术协会等机构主办的广州科普教育基地发展论坛在华南植物园举行；由广州市全民科学素质领导小组办公室等机构组织的广州科普基地科普能力建设沙龙活动在华南植物园举行。 

　　5月28日：华南植物园举行“中国科学院植物资源保护与可持续利用重点实验室”启动仪式并召开第一届学术委员会会议。 

　　5月：由傅声雷研究员和西双版纳热带植物园邹晓明研究员担任客座主编组织的Soil Biology & Biochemistry Special Issue （《中国专刊》）于2009年5月由Elsevier出版社发行。 

　　5月：“广州市第二届优秀科普作品评选活动”揭晓，华南植物园有4个参赛作品获奖，其中《光合作用与新能源》系列科普文章获优秀科普作品二等奖；《广州野生植物》和《有害花木图鉴》两本图书获科普作品三等奖。 

　　5月：华南植物园举办有毒植物科普展。 

　　6月1日：华南植物园与中国复大生物科技企业（集团）正式签署战略协议，就联合研发植物天然活性成分开展合作研究。 

　　6月1-6日：任海研究员访问巴西圣保罗大学，并与对方达成共同申请美国国家科学基金的初步框架及今后两年合作计划。 

　　6月3日：广东省外国专家局局长覃立模一行到华南植物园调研。 

　　6月9日：“广州生态公园群落”项目建设座谈会在华南植物园召开。 

　　6月10日：华南植物园宣布新一届党委、纪委组成成员。根据中科院党组《关于任海、魏平同志任职的通知》（科发党字〔2009〕39号），华南植物园第六届党委由任海、黄宏文、周国逸、魏平、邢福武、夏汉平、范德权等7位同志组成，任海任党委书记；第六届纪委由魏平、陈振焕、徐凤霞、莫汉坤、王瑞江等5位同志组成，魏平任纪委书记，莫汉坤任纪委副书记。 

　　6月10日：退休第一党支部被中科院党组办公室、离退休干部工作局评为中科院先进离退休党支部。 

　　6月16日：华南植物园选育的花卉新品种‘红绒蝴蝶兰’和‘麒麟火焰兰’在第32次农作物品种审定会上通过广东省农作物品种委员会审定。 

　　6月22日：中科院厅文件（科发际字〔2009〕2号）批准，华南植物园获得2009年度中科院“外国专家特聘研究员计划”立项。 

　　6月30日：“亚运广州行”礼仪日暨亚运倒计时500天群众文化活动在华南植物园举行。 

　　7月1日：华南植物园召开全体党员大会隆重纪念建党88周年。 

　　7月5日：共青团广东省委书记谭君铁一行10人访问华南植物园。 

　　7月8日：由广州市旅游局主办“广州旅游新亮点业内推介会”在华南植物园举行。 

　　7月13日：华南植物园“中秘生物多样性合作研究与能力建设合作计划”获中科院国际合作局批准，这是华南植物园首次承担院对外合作重点项目。 

　　7月15日：广东省副省长雷于蓝、省政协副主席姚志彬考察华南植物园。 

　　7月15-30日：园主任黄宏文研究员率科学考察队访问越南并进行植物资源考察和收集。考察期间与越南林业科学院等机构达成多项合作意向。 

　　7月17-27日：阿根廷苏尔国立大学Carlos Busso教授访问华南植物园并签订学术交流协议。 

　　7月30日：美国波音公司代表团访问华南植物园。 

　　7月：由华南植物园和香港植物标本室（Hong Kong Herbarium）共同合作主编的《香港植物志》第3卷（英文版）出版发行。 

　　8月11日：壳牌公司代表团到华南植物园进行访问和调研。 

　　8月12-15日：华南植物园参加第18届全国发明展览会，4项专利成果获奖。 

　　8月9-15日：加拿大农业部Yukio Kakuda和John Shi教授访问华南植物园。 

　　8月13-17日：“中国植物生理学会第十次会员代表大会暨全国学术年会”在河南开封召开，蒋跃明研究员当选为学会第十届副理事长。 

　　8月19日：中科院副院长詹文龙视察华南植物园。 

　　8月20日：华南植物园主持的广州市林业局招标项目“广州市陆生野生动植物资源本底调查”通过专家评审，并荣获“广东省环境保护科学技术奖二等奖”。  

　　8月21日：中科院院士、中科院高能物理研究所所长陈和生、副所长奚基伟一行访问华南植物园。 

　　8月23-25日：英国St Andrews大学Richard Abbott教授访问华南植物园。 

　　8月23-27日：任海研究员参加澳大利亚珀斯市召开的第19届国际恢复生态学大会。 

　　8月25日：蒋跃明研究员主持的“园艺产品采后品质的调控机制”项目荣获2008年度广东省科学技术一等奖。 

　　8月30日：“广州生态公园群落”建设研讨会在华南植物园召开。 

　　8月：邢福武研究员等主编的《中国景观植物》（上、下册）出版发行。 

　　9月1日：“广州森林公园群落”建设筹备会在华南植物园召开，广州市副市长陈国率17个部门负责人到会并发表讲话，正式启动该工作。这是华南植物园继三方共建后的又一重要院地合作工作。 

　　9月10日：华南植物园举行“2009年新生开学典礼暨入园教育大会”。 

　　9月10日：工会副主席潘小娟被国家体育总局授予“全国群众体育先进个人”称号，并在第十一届全国运动会期间给予表彰。 

　　9月12日：由广州市旅游局和第16届亚运会组委会服务部联合主办的“寻找广州美景最佳拍摄点”摄影大赛开镜仪式在华南植物园举行。 

　　9月16日：由英国、法国、捷克、马来西亚、泰国、印度尼西亚等国12位国际植物学家组成的代表团访问华南植物园。 

　　9月27日：由广东省林业局和省旅游局联合主办、华南植物园承办的“2009广东省森林生态旅游示范基地授牌暨森林生态游启动仪式”在我园隆重举行。 

　　9月27日：广东省政府副秘书长江海燕到广东中科琪林园林股份公司调研。 

　　9月：禹玉华高级工程师主编的《绞股蓝标准化生产技术》一书出版发行。 

　　10月13日：由任海研究员等申请的“一种潮间带种植红树林的方法”于获国家发明专利授权（专利号: ZL200610124054.4）。 

　　10月12日：澳大利亚科学院院长Kurt Lambeck博士和澳大利亚技术与工程学院副院长Peter Laver博士率领的科学家代表团一行32人访问华南植物园。 

　　10月12-16日：园主任黄宏文研究员应邀出席英国邱园250年园庆并在高端研讨会上作主题报告。 

　　10月12-21日：秘鲁植物学会理事长Betty Millan Salazar教授, 副理事长Blanca Leon教授及秘鲁国立圣马科斯大学Asuncion Cano教授一行应邀访问华南植物园。 

　　10月18日：园主任黄宏文研究员出席南京中山植物园80周年庆典并应邀作学术报告。 

　　10月20日：夏念和同志任园艺中心副主任；申卫军同志任鹤山丘陵综合试验站副站长。撤销经济植物研究所和园林与景观研究所。 

　　10月21日：马国华博士等完成的“一种檀香的组织培养快繁方法”获国家发明专利授权（专利号：ZL 200710032982.2）。 

　　10月22日：由国际植物园保护联盟（BGCI）资助，华南植物园、广东省野生动植物保护管理办公室和广东省自然保护区管理办共同主办的“濒危植物长梗木莲的保护生物学及回归引种”研讨会在广东龙门县南昆山自然保护区召开。 

　　10月23日：华南植物园举行首届“陈焕镛讲座系列”学术报告会，葛剑平、张大勇、牟溥、曹坤芳、朱瑞良、李来庚、田世平等7位来自全国各地的知名学者应邀作学术报告。 

　　10月24日：广东省种子管理总站组织专家对梁承邺、张明永和段俊研究员等选育的水稻不育系“植A”进行技术鉴定并获通过。 

　　10月25-30日：美国堪萨斯大学Daniel Crawford教授访问华南植物园。 

　　10月28日：华南植物园与广东永生源生物科技有限公司正式签署协议，合作组建“药用兰科植物研究中心”。  

　　10月30-31日：美国杜克大学著名生物学家Mark Rausher教授访问华南植物园。 

　　10月31日-11月2日：越南农业与农村发展部环境与科技司副司长Pham Van Mach博士带队，越南林业科学院院长Nguyen Hoang Nghia博士和越南林业大学林学院院长Nguyen Trong Binh博士等一行6人访问华南植物园。 

　　10月：傅声雷研究员获2009年度国家杰出青年科学基金资助，成为我园第三位“杰青”获得者。 

　　10月：工会副主席潘小娟同志被国家体育总局授予“全国群众体育先进个人”称号，并在第十一届全国运动会期间给予表彰。 

　　11月1-4日：瑞典农业大学教授David Wardle访问华南植物园。 

　　11月2日：华南植物园与美国农业部首席研究员区永祥博士签订“聘用合同书”，正式“落户”华南植物园。 

　　11月9-13日：园主任黄宏文研究员应邀作为评估专家前往英国对爱丁堡皇家植物园进行国际评估。 

　　11月17-20日：由华南植物园、New Phytologist Trust和广州市科学技术协会联合主办，中科院国际合作局、自然科学基金委赞助的“New Phytologist第23届国际学术研讨会--热带生态系统碳循环”在广州召开。 

　　11月18日：华南植物园80周年庆典大会在绿色文化广场隆重举行，国内外嘉宾代表及全园职工与研究生等1800多人参加庆典大会。结合园庆，编辑出版了《80周年纪念文集》、《80周年纪念画册》、《80周年纪念邮册》等园庆资料。 

　　11月18日：马国华研究员等完成的“一种报春苣苔（Primulina tabacum Hance）组织培养繁殖及野外栽培方法”获得国家发明专利授权（专利号: ZL200710030266.0）。 

　　11月18-23日：第三届海峡两岸森林动态样区研讨会在鼎湖山召开。 

　　11月19-20日：由美国密苏里植物园主任Peter H. Raven博士、国际植物园保护联盟（BGCI）秘书长Sara Oldfield女士、英国爱丁堡皇家植物园主任Stephen Blackmore博士等11位国内外知名专家组成的评估组对华南植物园进行了国际战略评估。 

　　11月20日：华南植物园与安徽康顺名贵中草药产业开发有限公司签署协议，合作开展“名贵中药材霍山石斛高效栽培技术研发与示范”研究。 

　　11月25日：华南植物园部署工程建设领域突出问题专项治理工作。 

　　11月：蒋厚泉主编的《走进自然植物科普丛书》出版发行。该套丛书包含《神秘的热带雨林》、《高山、沙漠植物》和《奇花异果》3册。 

　　12月1-21日：由国家国商务部主办，华南植物园承办的援外项目“热带/亚热带森林生物多样性跨国界保护研究及管理研修班”于在华南植物园举行。来自秘鲁等10个国家的18位学员参加研修班的培训。 

　　12月2日：卢乃弟同志被广东省侨联评为侨联系统先进个人。 

　　12月4日：华南植物园主持的 “广州市典型人工林林下乡土树种的定居限制及其解除研究”通过广州市科技局组织的验收。 

　　12月5-6日：吴国江研究员等参加“2009年度中国植物生理学会生物质与生物能源专业委员会会议”。 

　　12月8日：蒋跃明研究员应邀出席在北京召开的第一届国家食品安全风险评估专家委员会议，并当选第一届国家食品安全风险评估专家委员会委员。  

　　12月9日：华南植物园承担的广州市重点科技攻关项目“亚运会开花的蝎尾蕉花卉新品种引进筛选及利用研究”通过广州市科技局组织的验收。 

　　12月12-13日：“十一五”国家科技支撑计划课题“节约型城镇绿地建设关键技术研究与开发”2009年度总结会议在华南植物园召开。 

　　12月18日：广东省人大副主任王宁生在中科院人教局副局长李婷的陪同下参观考察华南植物园，并开展植树活动。 

　　12月19日：全国人大常委会副委员长、中科院院长路甬祥视察华南植物园并做重要讲话。中科院副秘书长兼办公厅主任邓麦村、规划战略局局长潘教峰、生物局局长张知彬，以及广东省政府副秘书长、中科院广州分院院长陈勇、省人大副秘书长郑红、广州市人大副主任龙建安等有关领导陪同视察。 

　　12月24日：夏念和同志任广东省数字植物园重点实验室主任；免去任海同志兼任的广东省数字植物园重点实验室主任职务。 

　　12月25日：中共中央组织部人才局巡视员胡建华和副局长宋永华在中科院人教局副局长苗鸿及广东省委组织部有关同志的陪同下到华南植物园调研。 

　　12月28日：华南植物园举行第二届“陈焕镛讲座系列”学术报告会，顾红雅、葛颂、叶文才、何祖华、徐国良等5位来自全国各地的知名学者应邀作学术报告。 

　　12月29日：华南植物园申报的“中国科学院退化生态系统植被恢复与管理重点实验室”（实验室代码2009DP173224）正式获中科院批准成立。