内设试验苗圃、试验果园和引种驯化三个区。

（1）试验苗圃区：占地53公顷，内分为集约繁殖区、比较试验区、原始材料圃、苗木繁殖区、苗木移植区和花圃等。

（2）试验果园区：面积10公顷，设在苗圃以东小山岗上。

（3）引种驯化区：面积25公顷，选择火炉山南坡岑村水库周围，为北移植物试验地；其北坡为南移植物试验地。

（4）苗圃区的建筑群：有研究实验室、温室、荫棚、农具室、肥料室、车房及库房等。

2. 展览园地

（1）经济植物区：在进门右侧原水稻田及部分丘陵地，面积34公顷，按其用途类别分为果树、芳香、油料、纤维、淀粉、橡胶、单宁、木材、药用、饮料、绿肥和饲料等10余类，分别布置成各小区。

（2）棕榈植物区：在进门左侧的人工半岛上，面积2公顷，本区具有华南热带风光的特色，其中还具有经济价值很高的椰子、高级食油作物油棕、工艺用料蒲葵和姿态优美雅致的观赏植物，如假槟榔、散尾葵和皇后葵等。

（3）遗存植物区：设在棕榈植物区以北的人工半岛上，面积约2.5公顷，本区是介绍曾在古地质年代分布广、种类多，而现仅残存的植物，如部分蕨类植物、裸子植物和被子植物。研究遗存植物多植物进化、区系发展和古气候变化等研究工作，能提供有关的科学资料。

（4）蒲岗萌生林：在进门左侧的小山岗上，面积1.5公顷，有野生植物300余种，代表82个科。

（5）观赏植物区：在资源植物展览馆建筑群附近，设一观赏花乔木及多年生花卉展览区，面积约8公顷，以华南特有的大花乔木来布置，使之集中表现出南国特有的艳丽风采。

（6）植物区系区：在8.5公顷的平地上，以植物科属的代表种，按分类系统布置，作为植物分类标本园。

（7）引种驯化区：在3公顷面积的小半岛上，布置引种驯化成就展览区。

（8）树木园：在78公顷丘陵地上，按照生态类型和分类系统来布置，包括裸子植物、被子植物；单子叶植物中包括华南特产的棕榈类和竹园。

（9）植被类型区：分为海南热带雨林类型，面积11公顷；亚热带季雨林类型，面积8.5公顷；橙绿阔叶林类型，面积11.5公顷。

（10）中国山水园林区：在岑村大水库周围的丘陵地上，面积19公顷，其中包括兰花圃、山茶园、木兰园、蕨类及秋海棠园等。

（11）展览区的建筑群：有3640平方米的资源植物展览馆，1300平方米的热带植物温室和3250平方米的大荫棚等。

本园总面积约800公顷，按规划要求，内容庞什，科学门类多，拟分期逐步完成。在1959年初步完成1.5公顷的蒲岗萌生林展览区。计划在1960-1961年先布置一个面积3公顷的华南代表性经济植物区，和部分棕榈植物区，面积2公顷；遗存植物区，面积1公顷，以及观赏植物区，面积2公顷；此外，计划在原有15公顷临时苗圃的基础上，再开辟10公顷繁殖苗圃。

1959年10月中国科学院华南植物园筹建概况（图片由陈忠毅提供）。

华南植物园中心展览区示意图

I．棕榈植物区

II．　　  华南代表性经济植物区

III．　　 古老的遗存植物区

IV．　　  蒲岗萌生林★

V．观赏植物区

VI．　　  繁殖苗圃

VII．　　 移植苗圃★（现分类区）

VIII．　 裸子植物区★（现凤梨园内）

IX．　　  龙舌兰圃★（现凤梨园与蒲岗间草坪凤梨园侧）

X．木兰圃★（现凤梨园与蒲岗间草坪蒲岗侧）

XI．　　  桂花圃★（现蒲岗旁四季绿洲门口区域）

XII．　　 引种植物展览★（现大草坪办公楼附近区域）

XIII．　 棕榈广场★（现裸子植物区）

XIV．　　 竹圃★（现苏铁园及附近区域）

XV．　　  经济植物盆栽展览★（现分类区与药园附近小区域）

1. 资源植物展览馆

2. 米丘林纪念馆

3. 花卉展览馆

4. 王莲室

5. 兰科温室

6. 高山植物室

7. 热带沙漠植物室

8. 兰科及蕨类荫棚（现园林树木区绿林小卖部对面）

9. 荫棚★（现金夫人影楼后蕨园内）

10.休息避雨廊

11.工作室★（现金夫人影楼）

12.亭

13.花架

14.水榭

15.花廊及小卖部★（现蒲岗冰室内）

注：有★者为1959年国庆节展出部分。